تمامی تجهیزات فرودگاه، نشیمن‌گاه‌ها، دستشویی‌ها و... مرتب درحال ضدعفونی هستند و پس از هر عملیات پروازی در فرودگاه استریلیزه کردن، میکروب‌زدایی و گندزدایی صورت می گیرد. تمامی اتوبوس‌های حمل مسافر در روز در دو مرحله ضدعفونی می‌شوند. همچنین در شرکت‌ هواپیمایی کیش نیز تمامی خطوط پروازی ضدعفونی انجام می‌شود